Según la distribución de linux, los procesos de instalación son muy diferentes.

En este documento voy a enfocarme en los paquetes de Ubuntu y Linux Mint con el gestor de paquetes apt, considerando que son las distribuciones por las cuales los usuarios usualmente empiezan en el mundo Linux. Si necesitan ayuda para instalar paquetes en otras distribuciones, no duden en contactarme.

Este documento funciona con las ultimas versiones “LTS” de ubuntu (Jammy Jellyfish) y las versiones 21 de Linux Mint. Si tienen otra versión, el principio es el mismo y la mayoría de los comandos de apt funcionan igual, excepto los comandos que se refieren directamente a “Jammy” o lsb_release.

1 R

Voy a reproducir los comandos acá, si quieren entender mejor el proceso, referirse a https://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu/ o https://es.linux-console.net/?p=14068.

Existe un repositorio dedicado a los paquetes del CRAN (que maneja R y los paquetes de R) para apt.

Prerequisitos:

sudo apt update
sudo apt install software-properties-common dirmngr -y

Añadir el CRAN como repositorio de paquetes para apt:

En ubuntu (notar, eso funciona con todas las versiones LTS):

sudo add-apt-repository "deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu $(lsb_release -cs)-cran40/"

En Linux Mint 21 (potencialmente puede ser una solución, aunque imperfecta, en las versiones de ubuntu que no son LTS):

sudo add-apt-repository "deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu jammy-cran40/"

Hay un proceso de seguridad que necesita integrar llaves en el sistema apt:

wget -qO- https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu/marutter_pubkey.asc | sudo tee -a /etc/apt/trusted.gpg.d/cran_ubuntu_key.asc

Ahora pueden instalar R:

sudo apt update
sudo apt install r-base r-base-dev -y

2 Rstudio, LaTeX y pandoc

2.1 LaTeX

Rstudio es un ambiente de desarrollo para R, LaTeX permite escribir documentos pdf y los archivos de documentos de las funciones, y pandoc es un sistema de conversión de formatos de documentos (markdown, html, pdf, word etc.)

Para instalar LaTeX en Ubuntu linux, o Linux Mint, la solución más completa es:

sudo apt install texlive-full

Si tienen un espacio limitado, pueden utilizar:

sudo apt install texlive -y

Si utilizan texlive en lugar de texlive-full, es posible que no tengan todos los paquetes de LaTeX necesarios, pueden referirse a https://linuxconfig.org/how-to-install-latex-on-ubuntu-22-04-jammy-jellyfish-linux.

Anotar, si prefieren no instalar texlive, existe la alternativa de utilizar tinytex para tener una instalación minimalista de los elementos de LaTeX que podrían necesitar para rmarkdown, ver https://bookdown.org/yihui/rmarkdown-cookbook/install-latex.html

2.2 pandoc

Para instalar pandoc:

sudo apt install pandoc -y

2.3 Rstudio

RStudio no está en los repositorios apt para ubuntu, tienen que descargarlo y instalarlo:

Para Linux Mint 21 y Ubuntu 22.04 Jammy Jellyfish:

wget https://download1.rstudio.org/electron/jammy/amd64/rstudio-2023.09.1-494-amd64.deb
sudo apt install ./rstudio-2023.09.1-494-amd64.deb

Para otras versiones, mirar: https://posit.co/download/rstudio-desktop/

3 PostgreSQL, postgis, SQLite y spatialite

Para instalar todos los paquetes SQL que vamos a necesitar (eso es valido el 1 de noviembre de 2022):

sudo apt install postgresql postgresql-contrib postgis postgresql-14-postgis-3 sqlite3 libsqlite3-mod-spatialite -y

4 Interfaces para SQL

Vamos a utilizar DBeaver. Como para R, tenemos que instalar un repositorio particular para DBeaver:

curl -fsSL https://dbeaver.io/debs/dbeaver.gpg.key | sudo gpg --dearmor -o /etc/apt/trusted.gpg.d/dbeaver.gpg
echo "deb https://dbeaver.io/debs/dbeaver-ce /" | sudo tee /etc/apt/sources.list.d/dbeaver.list
sudo apt update
sudo apt install dbeaver-ce -y

Si quieren, pueden instalar una interfaz especifica para PostgreSQL:

sudo apt install pgAdmin4

5 QGIS

Existen soluciones para instalar las ultimas versiones de QGIS (ver https://www.qgis.org/en/site/forusers/alldownloads.html), pero la versión en los repositorio por defecto es suficiente para el curso:

sudo apt install qgis python3-qgis

6 Git

Git es un software libre de control de versión (para grabar y seguir los archivos en la carpeta de un proyecto).

sudo apt install git

Instalaciones

1 R