Instalación de software para el curso Biodata en MacOS
Anotar: no conozco mac OS, lo unico que puedo hacer es mirar en la documentación en internet cuales son las soluciones que me parecen correctas y compatibles con las actividades del curso… Si alguien tiene más conocimientos de este sistema y quiere ayudarme ¡bienvenido!
Vamos a necesitar poder compilar los paquetes de R para obtener las ultimas versiones, seguir: https://mac.r-project.org/tools/ (sobretodo la primera parte con Xcode y el compilador de fortran)
Parece que la pagina https://www.reed.edu/data-at-reed/software/R/r_studio.html es un buen recurso para buscar como instalar R Rstudio y los componentes LaTeX de rmarkdown
https://medium.com/@sorenlind/create-pdf-reports-using-r-r-markdown-latex-and-knitr-on-macos-high-sierra-e7b5705c9fd parece completo tambien!
Vamos a necesitar PostgreSQL y postgis (su extensión espacial).
Parece que la applicación postgres.app contiene todo lo que necesitamos
Parece que para instalar spatialite, la extension espacial de SQLite la mejor solución es brew (https://medium.com/@carusot42/installing-and-loading-spatialite-on-macos-28bf677f0436).
Ahora bien, no les puedo asegurar que sea util instalarla… En Windows me dí cuenta que no era muy útil porque los software que ibamos a utilizar como interfaz ya tenían encapsulado SQLite y spatiaLite, así que tal vez, lo más practico es que no lo instalen y que miremos si funciona juntos (de todas formas, no es pesado instalar esos programas si los necesitamos)
Vamos a utilizar DBeaver, que es disponible como dmg en https://dbeaver.io/download/
Para instalar Qgis, programa de sistema de información geografica libre, seguir las instrucciones en https://www.qgis.org/es/site/forusers/alldownloads.html#mac-os-x-macos. No es necesario utilizar los macports, la versión “Todo-en-uno” debería ser suficiente.
Lo más probable es que instalaron git al momento de instalar XCode, por favor averiguar según las explicaciones de https://www.hostinger.co/tutoriales/instalar-git-en-distintos-sistemas-operativos